２００２年,，鄒巨元擔任鐘水中學校長,。６年時間里,，在他的帶領下,，鐘水中學取得了一項又一項可喜的成績,，學校先后被評為“郴州市園林式單位”,、“郴州市規(guī)范教育收費示范學?！?、“校本教研先進單位”,、“教育科研先進單位”,、“師生綜合素質大賽先進單位”、“教師專業(yè)考試人平綜合成績優(yōu)勝單位”,，連續(xù)三年學校榮獲綜合目標管理考核一等獎,、初三畢業(yè)會考“一平二率”優(yōu)秀單位。

作為一名校長,，鄒巨元深知自己既是學校的管理者又是學校的教育工作者,，因而在工作中，他時時處處為師之表,，率先垂范,。凡是要求老師做到的，他自己首先做到,。他知道當了校長,，只是職務發(fā)生了變化，但教書育人的本色依然不能改變,。一直以來,，他以教員的身份戰(zhàn)斗在教學第一線，備課,、上課,，課后輔導學生，做學生的思想工作,，樣樣仔細,、認真，所教的生物課深受學生的歡迎,。在教書育人的同時,，鄒巨元積極投身于教研教改中,，自覺參加每周的科組教研活動，每期聽課不少于３０節(jié),。在鄒巨元勤奮務實的工作作風影響下,，全校教師紛紛投入到教研教改工作中，該校教育科研活動空前高漲,，綜合教研組向市教育學會申報的《面向全體,，因材施教》課題獲得立項，填補了該校辦校以來市級課題項目的空白,。一大批教師的教研教改論文先后獲得國家,、省、市,、縣一等獎,。他本人撰寫的論文《新課改理論下的成才與特色教育》發(fā)表于人民教育教研年鑒，《生物教師應如何面對創(chuàng)新教育》發(fā)表于當代教育參考雜志并獲一等獎,。

 “擔任一種職務,，就是承擔一種責任?！编u巨元經常說,。擔任校長以來，他把主要精力都用在思考學校如何發(fā)展的問題上,，他審時度勢,，立足校情，綜合當前教育發(fā)展的趨勢,，確立了“打造特殊學校,、品牌學校，改善育人環(huán)境,，提高辦學水平”這樣一個總體目標,。建立健全各項規(guī)章制度，充分調動每一位教職員工的積極性和主動性,，使學校呈現(xiàn)出“團結奮進,、和諧發(fā)展”的良好勢頭，教育教學秩序穩(wěn)步推進,。

明明白白做事,，堂堂正正做人，是鄒巨元為人處事的基本原則,。對于學校的重大開支,、重大決策，均由班子成員會議討論后再作決定，并充分發(fā)揮教代會作用,，實行校務公開,、，財務公開,，自覺接受全體教職工的監(jiān)督,。他時常告誡自己：身為一名黨員干部，只有樹立清正廉潔的黨員形象,，才能挺直腰桿說話,，他是這樣說的，也是這樣做的,。從２００２年擔任學校負責人以來,，他未報一分差旅費和電話費。正是有了這樣的領頭雁,，學校各項工作都開展得非常順利，也深得上級領導的好評,。